γ射线照后不同时间点人肝细胞基因差异表达谱的研究

doi:10.3969/j.issn.1004-616x.2011.06.003

›› 2011, Vol. 23 ›› Issue (6): 416-420.doi: 10.3969/j.issn.1004-616x.2011.06.003

γ射线照后不同时间点人肝细胞基因差异表达谱的研究

张伟，秦秀军，许超琪，李炜宾，尹晶晶，袁慧，李建国

中国辐射防护研究院放射医学与环境医学研究所，山西太原 030006

收稿日期:2011-09-19 修回日期:2011-09-22 出版日期:2011-11-30 发布日期:2011-11-30
通讯作者: 张伟

Differential gene expression profile in human hepatocytes irradiated by γ-rays after different time points

ZHANG Wei，QIN Xiu-jun，XU Chao-qi，LI Wei-bin，YIN Jing-jing，YUAN Hui，LI Jian-guo

Department of Radiation Medicine and Environment Medicine, China Institute for Radiation Protection, Taiyuan 030006, Shanxi, China

Received:2011-09-19 Revised:2011-09-22 Online:2011-11-30 Published:2011-11-30
Contact: ZHANG Wei

摘要/Abstract

摘要： 目的：对γ射线照射后4和24 h人肝细胞株的差异表达基因进行筛选，为从基因水平上揭示放射性从业人员肝脏的早期损伤提供依据。方法：利用全基因组基因芯片技术，对人正常肝细胞7702给予不同剂量 (0.5和1.0 Gy)γ射线照射不同时间 (4和24 h) 后的基因差异表达谱进行筛选和分析。结果：照后4 h在不同剂量水平上(0.5和1.0 Gy)筛选出差异表达基因218个；照后24 h不同剂量水平上(0.5和1.0 Gy)筛选出差异表达基因1 475个；0.5 Gy剂量水平上照后不同时间(4和24 h)筛选出差异表达基因235个；1.0 Gy剂量水平上照后不同时间(4和24 h)筛选差异表达基因170个；最后筛选出共同的差异表达基因129个；另外还发现了一些有意义的通路途径，如胰岛素合成与分泌途径等；同时为了验证基因芯片筛选结果的准确性，进一步采用SYBR 绿色实时荧光定量PCR技术，对胰岛素生长因子2结合蛋白3 (IGF2BP3)及早期响应因子1 ( EGR1)两个有意义且表达量稳定的辐射后差异表达基因进行了验证，结果显示其定量结果与芯片检测结果趋势一致。结论：γ射线辐照后共筛选出差异表达基因129个，辐射对人肝细胞的早期损伤表现为多靶点、多层次及多通路等特点。

关键词: γ射线, 肝细胞, 基因芯片, 差异表达基因

Abstract: OBJECTIVE: To provide gene-level evidence for hepatic early damage of staff exposed to irradiation. METHODS：The study analyzed the differential gene experession profile of normal human hepatocytes and human hepatocytes irradiated at 2 different doses (0.5 and 1.0 Gy γ- rays) using whole genome chip after 4 and 24 h. RESULTS：There were 218 differentially expressed genes irradiated with 2 doses after 4 h，and there were 1 475 differentially expressed genes irradiated with 2 doses after 24 h. There were 235 differentially expressed genes irradiated with 0.5 Gy in 2 time-points. There were 170 differentially expressed genes irradiated with 1.0 Gy in 2 time points. There were 129 differentially expressed genes irradiated with 0.5 Gy and 1.0 Gy at 4 h and 24 h. Some interesting pathways such as insulin synthesis and secretion were found. The quantities of IGF2BP3 and EGR1 mRNA analyzed with real-time PCR were consisitent with gene chip. CONCLUSION：There were 129 differentially expressed genes identified. Irradiation caused early damage to human hepatocytes at many targets，many levels and through many pathways .

Key words: γ-rays, hepatocytes, gene chip, differential gene expression

张伟，秦秀军，许超琪，李炜宾，尹晶晶，袁慧，李建国. γ射线照后不同时间点人肝细胞基因差异表达谱的研究[J]. , 2011, 23(6): 416-420.

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[1]	国瑞贤, 谢广云, 韩莹. 基于转录组测序方法研究加替沙星对小鼠的肝损伤作用[J]. 癌变·畸变·突变, 2022, 34(1): 20-24.
[2]	王苗, 王全凯, 李昕苇, 马顺鹏, 乌瀚宝栎尔, 许建宁. 甲基丙烯酸环氧丙酯诱导16HBE细胞恶性转化相关m⁶A修饰异常mRNA的分析[J]. 癌变·畸变·突变, 2021, 33(6): 405-409.
[3]	杨婵君, 陈雯恬, 刘静. 胶原蛋白作为胃癌潜在生物标志物的生物信息学分析[J]. 癌变·畸变·突变, 2021, 33(6): 410-419.
[4]	焦文静, 张金艳, 马鸣, 郭秀娟, 冯军花, 邵俊国, 焦文鹏. 异黏蛋白与叉头框蛋白M1在肝细胞癌中的表达及其临床意义[J]. 癌变·畸变·突变, 2021, 33(5): 349-353,359.
[5]	田薇, 方延, 吴晗恬, 吉布强, 夏昭林. 长链非编码RNA与mRNA在急性髓性白血病中的异常表达及其功能初探[J]. 癌变·畸变·突变, 2021, 33(2): 110-115.
[6]	林凯煌, 蔡高阳, 刘新城. mTOR抑制剂AZD2014对肝癌细胞的增殖抑制作用及其机制研究[J]. 癌变·畸变·突变, 2020, 32(6): 448-451.
[7]	秦双建, 李柏茹, 蔡颖, 郑凯, 王冰玉, 李闰冰, 肖芳, 曾明, 徐新云. PM_2.5对L02肝细胞部分癌基因和凋亡相关基因表达的影响[J]. 癌变·畸变·突变, 2020, 32(4): 281-285.
[8]	古丽扎热叶·艾库拉, 谭遥, 帕力达·阿皮孜阿吉. 新疆哈萨克族食管鳞癌与长链非编码RNA表达的关系[J]. 癌变·畸变·突变, 2020, 32(3): 194-197,202.
[9]	王呈谕, 刘晓璇, 李轶群, 李登科, 孙震晓. 何首乌、虎杖、大黄水提物中游离蒽醌含量的测定及对人正常肝细胞的毒性作用[J]. 癌变·畸变·突变, 2020, 32(3): 215-220.
[10]	王冰玉, 蔡颖, 郑凯, 谢红卫, 徐新云. PM_2.5对HBE细胞致癌致突变相关基因表达的影响[J]. 癌变·畸变·突变, 2020, 32(1): 33-38,42.
[11]	马莉莉, 张树丽, 李琴, 许彭, 封敏, 李秀梅. 新疆哈萨克族食管癌与正常组织间差异表达miRNA的筛查及验证[J]. 癌变·畸变·突变, 2020, 32(1): 52-56.
[12]	王春燕, 佟鹏, 李辰, 邵帅, 曲功霖, 苟巧, 王成芳, 齐雪松. 纳米氧化铈颗粒对人肺腺癌耐顺铂细胞辐射敏感性的影响[J]. 癌变·畸变·突变, 2019, 31(6): 464-468.
[13]	曾蕾, 徐雪莲, 罗曼曼, 张凡, 韩志坚, 李玉民. 胃癌基因表达谱芯片差异基因的生物信息学分析[J]. 癌变·畸变·突变, 2019, 31(4): 300-307.
[14]	高杰, 张晓, 魏超. 差异表达miRNA在胰腺癌预后判断中的价值[J]. 癌变·畸变·突变, 2019, 31(3): 173-179.
[15]	毕延伟, 杨小强, 孙平楠, 周小玲. HBV研究模型新进展[J]. 癌变·畸变·突变, 2019, 31(2): 166-170.

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